如果仅仅是免职，也许这对师徒关系还不至于发展到“成仇”的地步。关键在于免职后安瓦尔又被以“滥用职权”和“性犯罪”这两项罪名被捕入狱。此后，安瓦尔也就进入了“出狱再入狱”的恶性循环中。尽管马哈蒂尔一再否认与他有关。但显然，安瓦尔将这笔账记在了马哈蒂尔头上。自此后，安瓦尔组织了人民公正党，并以反对派领导人的身份和马哈蒂尔以及马哈蒂尔的另两位接班人巴达维和纳吉布相斗了二十年。
经过多年经营，纳吉布在执政联盟巫统中的根基已经非常牢固。如果再从巫统内部入手搞掉纳吉布的话，已经不现实。意识到这点后，极富政治手腕的马哈蒂尔决心另辟蹊径。那就是组织新党派，并通过选举战胜纳吉布，达到推翻纳吉布的目的。于是，马哈蒂尔组建了“土著团结党”。但是，仅以这个新党派和他本人的威望还不足以战胜有着60多年统治基础的巫统。于是，他想到了安瓦尔。因为安瓦尔的人民公正党是马来西亚的第一大反对党。但是，他和安瓦尔的结怨已深，安瓦尔也未必会和他合作。不过，老谋深算的马哈蒂尔还是想到了办法。因为，安瓦尔此时尚在监狱，肯定想出来。于是，马哈蒂尔以一旦获胜后将立即释放安瓦尔，以及在两年后将总理职位让给安瓦尔这两个“承诺”说服了安瓦尔。
本来，按照原先的承诺，马哈蒂尔将在今年5月份将总理职位让给安瓦尔。但是，后来又放风说等到11月份APEC会议开过后再交权。于是，安瓦尔及其人民公正党不干了！因为，安瓦尔看透了马哈蒂尔的心思，无非是不想交权。为此，安瓦尔开始“逼宫”了！
据马来西亚《今日大马》等媒体的报道，安瓦尔准备以“政府领导人所奉行的种族政治偏离了多元化治国方针”为由退出执政联盟。闻之此事后，马哈蒂尔决心再赌一把，于是，在23日他突然提出了解散执政联盟，重组政府的建议。他的目的就是想抢在安瓦尔之前通过改造政府来实现延续权力的目标。可是，拥有50个议会席位的安瓦尔已经“去意已决”，宁愿不要政权，也不愿再支持马哈蒂尔再任总理。所以，拒绝了马哈蒂尔的建议。这就令马哈蒂尔尴尬了！因为，如果不交权的话，自己的力量又无法单独组阁，那也就等于什么都没有了！于是，在权衡利弊之下，还是主动交权对自己最有利。所以，在24日，马哈蒂尔向最高元首递交了辞呈。想来，也是明智之举。这样的话，既保住了自己的利益，也不至于被人说成是“贪恋”权力。尽管心有不甘，但毕竟保住了没有“食言”的声誉。
