腔肠动物有专门的消化器官，称作胃腔，食物进入胃腔后，胃层的腺细胞开始分泌蛋白酶，分解、消化食物使之形成许多多肽，同时在胃腔中由于营养肌肉细胞的鞭毛运动，食物得以混合与推动。经这种细胞外消化之后，开始细胞内的消化过程，营养肌肉细胞的伪足吞噬食物颗粒，在细胞内形成大量的食物泡，经过酸性及碱性的化学过程之后，营养物质由细胞的扩散作用输送到全身。消化后的营养物通过各种管道输送到全身，未消化的食物残渣仍由口排出。
大多数的扁形动物没有专门的消化器官.靠寄生在人和动物体内.获取
扁形动物的消化系统由口、咽、肠组成,有的没有专门的消化器官,身体有口无肛门.扁形动物消化能力不足,除少数营自由生活外,大部分营寄生生活.
